L'uso delle piante per guarire malattie e disfunzioni è antichissimo, allo stesso tempo la moderna fitoterapia è una medicina che si serve di una metodologia scientifica molto attuale. Essa studia l'impiego delle piante medicinali e dei loro derivati in grado di svolgere un'azione farmacologica nell'organismo.
Le erbe e le piante medicinali presentano lo stesso tipo di attività che hanno i principi attivi da queste isolati. Per questo motivo almeno la metà dei farmaci di sintesi è nata copiando le molecole naturali, sfruttando così l'azione farmacologica e terapeutica delle piante. Va ricordato che, pur presentando un elevato margine di tollerabilità, le piante medicinali possono talvolta indurre effetti collaterali: la loro assunzione dovrebbe quindi avvalersi del consiglio qualificato di esperti, quali il farmacista e il medico.
La Farmacia dell'Arcangelo dispone di un vasto reparto dedicato alla medicina naturale: oltre alla fitoterapia e all'omeopatia è possibile trovare i Fiori di Bach, preparati a base di principi vegetali adatti a ristabilire l'equilibrio emotivo del soggetto. Si tratta di 38 fiori le cui proprietà sono state individuate negli anni Trenta del Novecento dal medico inglese Edward Bach, il quale ideò il metodo per estrarne e diluirne l'essenza.
Questi fiori possono essere assunti singolarmente o in associazione tra loro a seconda degli stati d'animo e delle necessità individuali.